重庆医科大学附属第一医院（简称重医附一院）拥有多项重点专科，以下是一些擅长的科室：
眼科
特色：国家临床重点专科、国家眼耳鼻喉疾病临床医学研究中心重庆分中心。在眼科疾病诊断、治疗和科研方面具有显著优势，尤其在复杂眼病的治疗上经验丰富。
心血管内科
特色：国家临床重点专科，西南地区最早的心血管病硕士、博士学位授权点。在心血管介入诊疗手术方面技术领先，年介入手术量大，承担大量疑难病例诊治。
血液内科
特色：国家临床重点专科建设项目，重庆市造血干细胞移植规范化培训基地。在血液肿瘤疾病的综合救治能力达国内国际先进水平，成功开展多种造血干细胞移植术。
胸外科
特色：卫生部国家临床重点专科，重庆市肺部肿瘤综合治疗中心。在肺部疾病、食管疾病及纵隔肿瘤的外科治疗等方面技术力量雄厚，整体医疗技术水平在西南地区及全国都有很高地位。
神经内科
特色：在神经系统疾病的诊断和治疗方面具有丰富的经验，尤其在帕金森病、阿尔茨海默病等神经退行性疾病的治疗上取得了显著成果。
风湿免疫科
特色：新兴学科，擅长重症系统性红斑狼疮、结缔组织病相关肺间质病变、类风湿关节炎、强直性脊柱炎等疾病的诊治。
精神心理科
特色：在精神心理疾病的诊断和治疗方面具有专业优势，尤其在心身疾病、睡眠障碍、儿童青少年情绪障碍等方面有独到的诊疗方法。
这些科室在各自的领域内都具有较高的专业水平和丰富的临床经验，为患者提供了优质的医疗服务。