农村合作医疗跨省报销流程如下：
- 转诊手续 ：
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在当前住院医院找到副主任以上级别的医师，开具转诊证明，并到医院的医务部盖上医院的公章。
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或者，通过电话联系参合地经办机构申请办理跨省就医转诊，并选择跨省定点医疗机构就医。
- 异地就医备案 ：
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携带转诊证明、身份证、新农合医疗证等相关材料，到当地社保局或医保管理部门办理跨省就医手续，并明确就医的城市及医院名称。
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可以通过手机APP或微信公众号进行线上备案，或者打电话给老家的医保部门办理。
- 住院治疗 ：
- 在异地定点医院接受治疗时，可能需要先自行垫付医疗费用。
- 出院结算 ：
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若当地支持新农合异地结算，可以直接在医院办理报销手续，报销原则为多退少补。
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若不支持异地结算，则需携带相关材料返回参保地办理报销。
- 报销材料 ：
- 出院时，需携带以下材料：诊断证明、费用清单、住院结算单、病历复印件、身份证、合作医疗证等。
- 报销比例 ：
- 报销比例根据就诊医院的等级有所不同。已办理转诊备案手续的，个人首先负担10%，剩余部分按照参保地三级医院报销政策审核结算；未办理转诊备案手续的，个人首先负担40%，剩余部分按照参保地三级医院报销政策审核结算。
建议：
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在报销之前，先咨询当地社保工作人员，确保手续完备，避免缺少资料。
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选择跨省定点医疗机构就医，以确保能够顺利报销。