肠溶胶囊需要在饭前吃。未进食之前，肠道内比较空，服用肠溶胶囊后能够快速到达肠道，继而在肠道内溶解起效；如果在饭后服用，肠溶胶囊会随着食物在胃内停留的时间过长。若停留时间过长，部分肠溶胶囊可能会在胃内溶解，不仅会对胃黏膜可能会造成损害，而且药物吸收也不确切。
人体的消化器官中，胃内环境主要为酸性，肠道则是碱性。因为某些药物对胃的损害较大，所以在囊壳中加入特殊的药用高分子材料或经特殊处理制成肠溶胶囊，使其在胃液中不溶解，仅在肠液中崩解溶化。这样既可以满足药物性质及治疗的需要，又能避免该药物对胃的损害。
服用肠溶胶囊时的注意事项：服用时切忌嚼碎，以免药物在胃内过早释放而影响疗效。
