肝内钙化灶的临床症状与钙化灶的病因有关。
在临床上，大部分肝内钙化灶以良性病变为主，如腺瘤、囊肿、血管瘤等良性组织吸收后的机化表现，如果是此类情况，一般没有明显临床不适症状。
但如钙化灶体较大，可以出现右上腹部不适、食欲降低等表现，一般以动态观察为主。
少部分肝内钙化灶与恶性肿瘤形成有关，此类情况患者一般可出现体重减轻、食欲下降、局部疼痛、黄疸、发热等临床表现，需手术治疗。
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