在临床上引起甲状腺功能低下的原因，主要包括以下几种：
第一种情况主要是见于亚急性甲状腺炎。通常是因为病毒感染导致，一般亚甲炎引起的甲状腺功能低下，通常是短暂性的，经过对症治疗以后通常可以恢复。
第二种情况主要是见于慢性淋巴细胞性甲状腺炎。确切的发病原因不清楚，因为各种自身免疫性的因素，导致淋巴细胞侵犯甲状腺，从而引起甲状腺素的合成、释放减少，一般需要补充外源性的甲状腺素。
第三种情况主要是生理性的甲状腺肿。主要是见于儿童、青少年或者妊娠期，因为生理需量过大，而甲状腺素合成与释放不足所引起，通常补充碘剂甚至甲状腺素可以得到逆转。
第四种情况主要是见于甲状腺次全切除所引起，主要是见于甲状腺癌，通常需要长期补充外源性的甲状腺素。
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