儿童的发育迟缓一般是由脑发育功能障碍引起的，最常见的是围产期的因素，比如孩子有早产、宫内的缺氧、出生的窒息、出生后的黄疸都可以造成脑功能的损害。也有些孩子是和遗传代谢病有关，比如甲基丙二酸血症、戊二酸血症。也有些孩子可能和染色体的异常有关，比如二十一三体、十八三体。还有孩子可能和基因的缺陷有关。
儿童发育迟缓主要是神经发育的障碍，包括智力、认知、语言、运动以及社会交往等方面的障碍。所以对于发育迟缓的孩子，应该进行全面的神经系统的检查来评估病因。
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