HPV检查要通过检查病变部位脱落细胞才可以，所以男性检查比较困难，检查阳性概率比较低。有些医院男性科开展这个项目检查，可以用棉拭子或者毛刷刷取龟头部位的细胞或者是可疑病变部位的细胞，然后送检验科检查，检查阴性不代表没有感染。如果检查阳性，那么就一定是感染了，因为男性取细胞相对困难，所以阳性率不高。
一般在夫妻中，如果女性检测HPV阳性，因为可以通过性生活相互传染，然后建议男性去做一下检查，男性生殖器官局部有异常增生物的情况下，为了确诊是否感染了尖锐湿疣，可以局部做HPV的检测.如果是低危型阳性，那么就可以确明确诊断。
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