有些临床病人在进行肠镜检查时发现回肠末端有溃疡，回肠末端溃疡的原因有很多：
第一：肠道炎症性疾病，即炎症性肠病。炎症性肠病引起的回肠末端溃疡不能自愈，需要药物治疗。溃疡性结肠炎和克罗恩病都和自身免疫相关，需要服用药物，比较常用的有5-氨基水杨酸，甚至有些病人需要激素来治疗。
第二：肠道感染。服用抗生素之后可以好转，部分病人即便不服用药物也可以自愈。急性肠胃炎可能会引起暂时性的回肠末端的溃疡。
第三：肠道菌群失调。这类溃疡可以自愈。建议服用益生菌调节菌群紊乱，有利于促进回肠末端溃疡的愈合。
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