对于不同的疾病，灌肠的目的不同。如果是子宫肌瘤或者其他外科疾病，灌肠主要是清除粪便；如果是肛肠疾病，灌肠是要达到排气、刺激肠道蠕动、软化并清除粪便，同时要稀释肠道内的毒物、减少吸收作用、保护手术创面等。
手术前很多患者需要进行灌肠，主要是预防患者麻醉以后因为肛门括约肌的松弛，在手术台上排便，污染手术衣及手术巾。同时灌肠可以减轻术后的腹胀和便秘。
对于结肠、直肠和肛门的手术，灌肠有助于医生在术中看清手术部位；可以预防粪便污染腹腔的创面，减少术后伤口感染的机会。结肠、直肠、肛门等手术，术晨需要再灌肠一次。低位直肠癌压迫使得直肠狭窄的患者，灌肠时肛管应该通过狭窄的部位，可以有效清理肠道；高位直肠癌的患者不要使用高压灌肠，以免将癌细胞冲得向上种植。
患者在手术前一天上午10点左右服用番泻叶10克、冲水1500毫升，多次服用。如果排便1天内少于4次，手术前一晚需要进一步给予0.1~0.2的肥皂水进行灌肠。年老体弱的患者不服用番泻叶。一般灌肠不是很难受，放松即可。
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