有很多原因都可以引起房颤，房颤的发病机制不明确。第一，遗传因素可以引起房颤。遗传因素可以使离子通道异常，从而导致心脏电活动的异常，引起房颤心律的发作。
第二，如果左房和肺静脉之间存在先天性或者后天性的异常电路，甚至是折返的通道，也可以导致房颤心律的发作。
第三，后天性因素导致的心脏结构异常可以引起房颤心律。比如风湿性心脏病导致二尖瓣狭窄，就会引起左房增大，左房增大可以引起房颤心律；先天性心脏病中的房间隔缺损可以导致左心房不断增大，导致房颤心律的发作；各种类型的心肌病，包括扩张型心肌病、缺血性心肌病、肥厚性心肌病等，可以导致左房结构异常，引起房颤心律的发生。
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