如果发生卡氏肺孢子虫肺炎以后，还是需要进行抗感染治疗，除了治疗原发疾病，比如说纠正免疫功能低下的这个状况，比如说艾滋病的病人治疗艾滋病之外，还要针对卡氏肺孢子虫进行抗菌治疗。一般常用的抗生素就是抗生素抗菌油，除此之外还有一些其他的抗寄生虫的药物。
卡氏肺孢子虫肺炎主要是见于免疫功能严重低下的病人，比如婴幼儿、长期进行放化疗的患者，还有就是最多见的是艾滋病的患者。因为艾滋病病毒是一个侵犯免疫功能最严重的病毒，可以彻底摧毁患者的这个免疫功能，然后导致免疫力严重的低下的病人有机会性的感染。比如普通人平常接触到这个病原菌并不会发生感染，而这样的病人接触到这个病原菌就会发生感染。
卡氏肺孢子虫常生活在空气中、水中或者土壤中，并不是一个细菌、病毒，倾向于属于原虫，应该是属于真菌类的一种病原微生物，可以通过吸入或者是接触相关的物质发生感染。一般免疫力正常的人是不会发生感染的，免疫力低下的人发生这个感染以后，相对来说比较严重。
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