胃底静脉曲张是比较严重的疾病，治疗需要分情况而言。区域性的门脉高压也就是脾脏和胰腺疾病导致的胃底静脉曲张，往往没有食管静脉曲张。可以通过治疗原发病，对胰腺的肿瘤、疾病或脾脏的疾病做治疗，从而达到治疗胃底静脉曲张的目的。
胃底静脉曲张最常见的原因是肝硬化导致的，治疗需要分情况：如果胃底静脉曲张不是很严重，壁很厚、出血的风险很少时，可以通过药物来控制门脉的压力，减少静脉曲张出血的风险。很多病人比较严重的胃底静脉曲张并发出血时，主要通过内镜下的硬化加组织胶栓塞治疗，把曲张的静脉用胶栓塞掉，从而减少出血的可能性。如果内镜下的治疗效果不是很好，或者每次做治疗都会有严重的出血，或者反复治疗仍然有反复出血时，需要介入治疗。介入治疗可以通过经颈静脉肝体静脉分流术，也就是TIPSS的治疗。
胃底静脉曲张很大一部分往往合并异位的分流道，也就是胃底的静脉和肾脏、脾脏相通。当做内镜治疗时会出现严重的异位栓塞，比如在胃底打的胶异位到肾静脉导致肾栓塞，出现肾功能的损害。所以做胃底静脉曲张和食管静脉曲张相比，风险更大，要注意排除有异位分流道的出现的可能性，提前预判处理。有的病人还要做暂时的栓堵来进行打组织胶的治疗，一部分胃底静脉曲张可以通过脾切以及断流或者分流术的治疗，也就是手术治疗。
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