一般脑干肿瘤的早期症状，是交叉性的麻痹及病变侧的颅神经或神经核团的损害，随着病变的脑干部位不同，出现不同的体征。脑干肿瘤容易造成导水管或第四脑室的梗阻，导致梗阻性脑积水，出现颅内压增高的症状及体征，如头疼、呕吐、眼底视乳头水肿、颈部强直等症状。根据肿瘤生长的不同部位发展成不同的症状，比如出现一侧眼外展神经麻痹，考虑到脑干桥脑肿瘤；眼球上视不能考虑到脑干中脑肿瘤；若是麻木或者无力，可以想到脑干的长束受到影响。最容易误诊的是头晕或眩晕，常会因为考虑是脑缺血或其他的原因而容易误诊。
脑干是人体的生命中枢，主管呼吸、心跳、意识、运动、感觉等。经过医学多年的探索研究及手术技巧的提高，许多脑干良性病变如海绵状血管瘤，都是可以治愈的。恶性脑干肿瘤，也可以通过手术减轻症状、延长寿命。
