西藏阿里社保基数为13900元时的扣税金额取决于适用的税率和速算扣除数。根据中国个人所得税的计算方法，假设没有其他免税额和专项附加扣除，仅考虑社保缴费部分对个税的影响，以下是计算过程：
社保缴费部分计算
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养老保险：
- 单位缴费比例：16%
- 个人缴费比例：8%
- 缴费金额：13900 × 8% = 1112元
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医疗保险：
- 单位缴费比例：6.5%
- 个人缴费比例：2%
- 缴费金额：13900 × 2% = 278元
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失业保险：
- 单位缴费比例：0.5%
- 个人缴费比例：0.5%
- 缴费金额：13900 × 0.5% = 69.5元
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工伤保险和生育保险：
- 由单位全额缴纳，个人不缴费。
个人缴费合计
- 个人缴费合计：1112 + 278 + 69.5 = 1459.5元
个人所得税计算
在中国，个人所得税的计算通常涉及累计预扣法，首先扣除五险一金（包括社保和公积金）等专项扣除、起征点（目前为5000元），然后根据适用的税率和速算扣除数计算应纳税额。
由于具体的税率和速算扣除数会随政策调整而变化，且可能涉及其他免税额和专项附加扣除（如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等），建议使用官方的个人所得税计算工具或咨询当地税务机关以获取准确的扣税金额。
请注意，以上信息仅供参考，具体扣税金额请以实际计算结果为准。
