西藏阿里社保基数13900元和5000元的核心区别在于缴费金额、待遇水平及长期权益：高基数（13900元）缴费更高但养老金、医保报销等福利显著提升，低基数（5000元）短期负担轻但长期保障较弱。
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缴费金额差异
以养老保险为例，基数13900元按24%总比例（单位16%+个人8%）计算，月缴3336元；基数5000元月缴1200元。医疗保险、失业保险等其他险种缴费金额同样按比例递增，高基数年缴费总额约为低基数的2.78倍。 -
养老金待遇差距
养老金计算中，高基数对应的平均缴费指数更高（如13900元约为社平工资的1.2倍，5000元约为0.43倍），直接提升基础养老金金额。个人账户部分，高基数每月个人缴费1112元（13900×8%），30年缴费可多积累约25.6万元，退休后月领养老金差距可达2000元以上。 -
医保报销与失业金差异
高基数参保者享受更高的医保报销封顶线和比例，年度报销额度可提高50%以上；失业保险金按缴费基数比例发放，高基数领取金额约为低基数的2.8倍。 -
企业成本与合规风险
企业为员工选择5000元基数虽降低成本（月少缴约2136元），但若员工实际工资高于最低基数6928元，可能面临社保稽核补缴风险。高基数则完全合规，但需承担更高用工成本。
总结：选择基数需权衡短期压力与长期收益。高收入群体优选高基数以最大化未来保障，经济紧张者可暂选低基数，但建议随收入增长逐步提高缴费档次。灵活就业人员可在6928元至34638元间自主调整，每年仅一次变更机会。
