保险等待期内查出疾病是否理赔需分情况：若确诊为合同约定的疾病，多数情况下保险公司会拒绝赔付；若等待期内检查出异常但未确诊疾病，且后续确诊不在等待期内，通常可正常理赔。
等待期又称观察期，是指在医疗保险、重大疾病保险等以约定疾病为给付保险金条件的保险产品中，保险消费者在首次投保时，从合同生效之日起的一段时间内发生的保险事故，保险公司不承担给付保险金责任。普通住院类医疗保险等待期一般为30天、60天或90天；重疾险和寿险等待期通常为90 - 180天，甚至1年。
等待期内出险分多种情况。一是等待期内罹患普通疾病，若该疾病未在等待期后引发合同约定的重大疾病，不影响合同效力及后续理赔；若会引发等待期后确诊合同约定的重大疾病，部分保险公司会拒绝等待期后的重疾理赔，严重的会影响合同效力。二是等待期内罹患轻症/中症，多数重疾险产品中轻、中症责任处理意见相同，常见三种处理方式，即该项疾病不理赔但轻/中症责任继续有效、合同继续有效；轻/中症责任终止但合同继续有效；最严重的情况是退保费/现金价值，合同失效。三是等待期内罹患重疾，一般解约保险合同并退现金价值。四是等待期内体检异常或检查出健康告知中提到的问题，通常无须再告知，只要投保前没有该问题且符合健康告知，不影响后续理赔。
对于等待期内是否确诊很重要。若等待期内检查出异常但未确诊疾病，等待期后才确诊为合同约定的疾病，就容易出现理赔纠纷。不同保险公司及不同产品条款在这方面的处理有所不同，有的产品以等待期内症状出现为由拒赔，有的则需在等待期内确诊才拒赔。
保险设置等待期是为了防止投保人逆选择的道德风险，控制理赔风险，保护其他保险消费者的利益。
消费者在投保前应仔细阅读保险条款，了解等待期的具体规定和相关理赔条件，避免后续可能出现的理赔纠纷。若在等待期内出现健康问题，应及时与保险公司沟通确认。
