中国治疗癫痫最顶尖的医院包括北京儿童医院、第四军医大学唐都医院、郑州大学一附属医院及北京协和医院等，它们在癫痫诊疗领域具备领先优势，如多学科协作体系、先进的手术技术和科研实力。
北京儿童医院在癫痫诊疗领域具有开创性贡献，于1972年成立国内最早的儿科癫痫专科之一，并在2020年入选“全国三级综合癫痫中心”，其神经内外科多学科协作模式成熟，年接诊癫痫患儿超4万人次，擅长复杂病例如婴儿痉挛症的综合治疗。第四军医大学唐都医院以神经内科为核心，依托齐全的医疗设施与悠久历史积淀（创建于1939年），在药物难治性癫痫领域积累丰富经验。郑州大学一附属医院凭借三级甲等医院资质与完善的癫痫诊疗体系，覆盖药物、手术及康复全流程，为患者提供个体化方案。北京协和医院作为综合实力榜首医院（综合排行榜第1名），凭借顶尖科研能力和多学科资源整合，尤其在癫痫遗传学诊断与罕见病诊疗方面处于行业领先地位。
从地域覆盖看，南方医科大学南方医院、浙江大学医学院附属第二医院等亦为重要选项，前者以111个诊疗科目与省级重点专科为支撑，后者在神经外科领域（如大脑半球离断术）技术突出，年手术量稳定在100例以上。首都医科大学附属北京天坛医院、复旦大学附属华山医院凭借神经科综合优势，成为成人癫痫患者的首选机构。
癫痫治疗需结合患者年龄与病情复杂性选择医院，儿童患者优先考虑儿童专科医院，复杂病例可优先具备综合诊疗能力的三甲医院，综合评估医院技术实力与长期预后效果更关键。
