好医保住院医疗和长期医疗均有等待期设置，但存在不同情况，好医保住院医疗等待期通常为90天，长期医疗一般疾病医疗有30天等待期，续保和意外医疗无等待期，且90天等待期的产品因连续合同或意外伤害住院无等待期。
好医保住院医疗的等待期为90天，从合同生效之日起开始计算。在等待期内，如果被保险人因疾病发生保险事故，保险公司不承担支付责任。不过，若被保险人因意外伤害住院，则不受等待期限制，保险公司会按照合同约定进行赔付。比如，小张购买了好医保住院医疗，在合同生效后第50天因意外受伤住院，这种情况下保险公司会正常理赔；但如果是因疾病住院，保险公司则不会在等待期内给予赔付。
好医保长期医疗的等待期方面，一般疾病医疗有30天等待期。若被保险人在首次投保或非连续投保的情况下，合同生效后30天内因疾病就医产生费用，保险公司不负责报销。但如果是续保或者因意外伤害住院，就没有等待期的限制。例如李女士购买了该长期医疗险，合同生效后的第20天不幸确诊疾病住院，由于还在30天等待期内，保险公司不会报销相关费用；但如果是之前已连续投保，后续续保成功后马上因疾病住院，或者在合同生效后因意外受伤住院，就可以正常申请理赔。而且像好医保这类优质长期医疗保险，像保证续保6年或20年的百万医疗险，若在等待期内发生非意外医疗费用，保险公司不承担支付责任。
在讨论等待期时，要明确等待期是保险公司为防范道德风险和欺诈行为而设置的措施。像好医保这类能报销严重疾病医疗费用并保证续保的产品，从合同生效到等待期结束这段时间内，即便被保险人发生保险事故，受益人在等待期内也无法获得赔偿。还有一些特殊情况要注意，如因连续的合同或意外伤害住院则不受等待期限制，在等待期内进行转外就医等特殊医疗行为也有相应规定，比如转外就医需提前报备，病情紧急时应在7日内补办手续；异地安置、异地工作者需事先办理报备手续且居住、工作需满半年以上等。
