广西来宾社保基数为5900时，扣税情况如下：

1. 1.社保缴费比例：养老保险：个人缴费比例为8%，即5900元×8%=472元。医疗保险：个人缴费比例为2%，即5900元×2%=118元。失业保险：个人缴费比例为0.5%，即5900元×0.5%=29.5元。工伤保险：个人不缴费。生育保险：个人不缴费。住房公积金：假设缴费比例为12%，即5900元×12%=708元。
2. 2.应纳税所得额计算：应纳税所得额=工资-五险一金-免征额。假设免征额为5000元，则应纳税所得额=5900元-(472元+118元+29.5元+708元)-5000元=-427.5元。由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。
3. 3.具体扣税情况：个人所得税：由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。社保及公积金扣款：共计1327.5元（472元+118元+29.5元+708元）。
4. 4.实际到手工资：实际到手工资=工资-五险一金-个人所得税。即5900元-1327.5元=4572.5元。

广西来宾社保基数为5900元时，个人需要缴纳的社保及公积金共计1327.5元。由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税，最终实际到手工资为4572.5元。对于有更多收入来源或更高工资水平的个人，建议详细了解个人所得税的累进税率，以便更好地进行税务规划。