广西贵港社保基数5900元和5000元的主要区别体现在以下方面：

缴费金额差异

• 养老保险：以8%的个人缴费比例计算，5900元基数时，个人每月养老保险缴费为5900×8%=472元；而5000元基数时，个人每月养老保险缴费为5000×8%=400元。
• 医疗保险、失业保险等其他险种：缴费金额也会因基数不同而有差异，整体而言，5900元基数下每月缴纳的社保总费用会高于5000元基数。

养老金待遇差异

• 养老保险遵循“多缴多得”原则。缴费基数高，在计算养老金时，基础养老金部分会更高。假设两人缴费年限等其他条件相同，仅缴费基数不同，5900元基数的人在退休后领取的养老金会高于5000元基数的人。

医保个人账户划入金额差异

• 医疗保险方面，基数高的话，医保个人账户划入的金额会更多。例如，若某地医保个人账户划入比例为2%，5900元基数下，每月医保个人账户划入金额为5900×2%=118元；5000元基数下，每月医保个人账户划入金额为5000×2%=100元。

广西贵港社保基数5900元和5000元在缴费金额、未来养老金待遇以及医保个人账户划入金额等方面均有明显区别。参保人可根据自身经济状况和未来保障需求等综合考虑选择合适的社保基数。