在深圳，对于社保基数设定为4900元的职工来说，每月需缴纳的五险一金和个人所得税将根据具体的缴费比例和扣除标准计算。社保缴费包括养老保险、医疗保险、失业保险等，而个人所得税则取决于扣除社保后的应纳税所得额以及适用税率。
针对社保部分，养老保险的个人缴费比例通常是8%，这意味着在社保基数为4900元时，个人需要缴纳的养老保险费用为392元（4900元8%）。医疗保险方面，个人承担的比例大约为2%，即98元（4900元2%）。失业保险的个人缴费比例相对较低，通常为0.2%，也就是9.8元（4900元0.2%）。工伤保险和生育保险个人不需缴纳费用。如果按照住房公积金缴存比例上限12%来算，那么每月还需缴纳住房公积金588元（4900元12%）。这样看来，仅社保和公积金这两项，每月就需要从工资中扣除约1087.8元。
在计算个人所得税之前，必须先确定应纳税所得额。这涉及到从税前收入中减去起征点5000元以及专项扣除（如三险一金等），还有可能存在的专项附加扣除。假设没有其他专项附加扣除，且已知社保和公积金共计扣除1087.8元，则应纳税所得额为-687.8元（4900元-5000元-1087.8元）。由于应纳税所得额为负数，这意味着在此情况下无需缴纳个人所得税。
考虑到实际操作中可能会有其他的专项附加扣除项目，例如子女教育、继续教育、大病医疗等，这些都可以进一步减少应纳税所得额。在具体应用时，纳税人应当详细了解并充分利用所有可用的扣除项，以减轻税务负担。
总结而言，当深圳员工的社保基数设定为4900元时，其每月因社保和公积金需缴纳的金额约为1087.8元。鉴于此基数下的应纳税所得额低于零，理论上该员工在当前条件下无需支付个人所得税。实际情况会受到多种因素的影响，包括但不限于是否有额外的专项附加扣除等情况，因此建议定期关注最新的税收政策及个人财务状况的变化，确保准确无误地履行纳税义务。合理规划个人收支，利用好各类税收优惠政策，有助于提高个人净收入水平。
