自主缴纳医保后是否还会代扣，取决于具体的缴纳方式和政策规定。 通常情况下，如果个人已经通过自主缴费的方式完成了医保缴纳，那么系统将不会重复进行代扣。以下是详细的解释：

1. 1.自主缴费与代扣的定义：自主缴费：指参保人通过线上平台、线下窗口或银行转账等方式，自行缴纳医保费用。这种方式下，参保人需要主动操作并确认缴费成功。代扣：指参保人与银行或医保机构签订协议，授权在指定时间从个人银行账户中自动扣除医保费用。这种方式下，参保人无需手动操作，系统会自动完成缴费。
2. 2.自主缴费后是否还会代扣：一般情况下不会重复扣费：如果参保人已经通过自主缴费方式完成了医保缴纳，系统会记录缴费状态，并在代扣时间到来时自动跳过扣费步骤，避免重复扣费。特殊情况：如果参保人在自主缴费后，系统未及时更新缴费状态，可能会导致代扣尝试。此时，参保人可以通过医保机构或银行查询缴费记录，并申请退款或调整。
3. 3.如何避免重复扣费：及时查询缴费状态：参保人应在自主缴费后，及时通过线上平台或客服热线查询缴费状态，确保缴费成功。调整代扣设置：如果参保人选择长期自主缴费，可以联系医保机构或银行，暂停或调整代扣设置，避免不必要的扣费尝试。
4. 4.政策与地区差异：不同地区的政策：不同地区对医保缴纳的具体操作和政策可能有所不同，参保人需了解当地的具体规定。年度缴费周期：部分地区的医保缴纳有特定的年度周期，参保人需在规定时间内完成缴费，避免因逾期而导致的额外费用或保障中断。
5. 5.建议与注意事项：保持联系方式畅通：参保人应确保在医保机构登记的联系方式准确无误，以便及时接收缴费通知和提醒。定期检查缴费记录：建议参保人定期检查个人缴费记录，确保缴费无误，并及时发现和解决潜在问题。

自主缴纳医保后通常不会再进行代扣，但具体情况需根据当地政策和系统设置而定。参保人应主动了解相关流程，及时查询缴费状态，并合理调整代扣设置，以确保医保缴纳的顺利进行。