社保卡停用后重新缴纳农村合作医疗（新农合）的流程和注意事项如下：

一、重新参保的办理方式

1. 线下办理

   • 户籍地村委会/居委会 ：携带身份证、户口簿原件及复印件、近期免冠照片，前往户籍所在地村委会或居委会办理参保登记手续。

   • 医保经办机构 ：部分地区允许携带身份证、社保卡到当地社保经办机构或街道办办理个人续保手续，需提供银行账户以完成代扣。

2. 线上办理

   • 微信公众号/支付宝 ：通过当地推出的农合公众号或支付宝“市民中心”功能，输入身份信息查询并缴费。

   • 政府服务平台 ：登录当地社会保险网上申报服务平台，按指引完成缴费操作。

二、注意事项

1. 缴费时间

   • 新农合按年度缴费，停保后需在下一缴费周期开始时缴费即可。若错过集中参保期补缴，需缴纳1070元（含个人400元+政府补贴670元）。

2. 与职工医保的关系

   • 新农合与职工医保不可同时参保，需根据户籍性质选择其中一种。若已参加职工医保，则无法再参加新农合。

3. 特殊情况处理

   • 离职人员 ：若因离职导致社保中断，需先办理职工医保停保手续，离职后按上述流程重新参保。

   • 系统异常 ：若线上缴费失败，可等待1-2天退款，或联系当地社保中心咨询补缴流程。

三、法律依据

根据《中华人民共和国社会保险法》第二十四条、第二十五条规定，新型农村合作医疗实行个人缴费与政府补贴相结合，管理方式由国务院规定。