在安徽六安，社保基数 12400 元时，应纳税额的计算涉及多个步骤。明确社保扣除部分，养老保险个人缴纳比例为 8%，即 12400×8% = 992 元；医疗保险个人缴纳比例为 2%，12400×2% = 248 元；失业保险个人缴纳比例为 0.5%，12400×0.5% = 62 元。工伤保险和生育保险个人无需缴纳。社保个人缴纳部分总计 992 + 248 + 62 = 1302 元。

然后计算应纳税所得额，根据公式：应纳税所得额 = 月度收入 - 5000 元（起征点） - 专项扣除（社保等）。将数据代入，应纳税所得额 = 12400 - 5000 - 1302 = 6098 元。

根据个人所得税税率表，查找适用税率和速算扣除数。6098 元对应的税率为 10%，速算扣除数为 210 元。

最后计算应纳税额，应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数 = 6098×10% - 210 = 399.8 元。

当安徽六安社保基数为 12400 元时，在不考虑专项附加扣除等其他扣除项目的情况下，每月应缴纳个人所得税约为 399.8 元。实际扣税情况可能因个人具体扣除项目不同而有所差异，建议详细了解自身扣除情况以准确计算应纳税额。