关于农村医保重复缴费的处理方式，需根据具体情况选择合适方法，并遵循当地政策规定。以下是综合整理的解决方案：

一、确认重复缴费情况

1. 查询缴费记录 ：通过当地医保部门官网、手机APP或线下窗口查询个人缴费明细，确认是否存在重复缴费记录。

2. 核实缴费时间 ：注意区分“重复缴费”与“时间重叠缴费”（如城乡居民医保与职工医保），后者属于正常参保行为。

二、申请退费

1. 准备材料 ：需提供身份证、医保卡、缴费凭证、银行账户信息等材料。

2. 提交申请 ：向当地医保部门或乡镇人民政府提交书面申请，说明重复缴费原因并附上证明材料。

3. 审核与退费 ：医保部门审核通过后，将退费金额退还至指定银行账户。注意退费时间可能因地区而异，部分地区规定在医保生效后2年内可申请退费。

三、保留一份并终止另一份

1. 评估需求 ：若同时参加城乡居民医保与职工医保，需根据医疗保障需求保留一份参保关系。

2. 提交申请 ：向医保部门提交书面申请，终止重复参保关系，并提供相关证明材料。

3. 处理后续 ：终止后，重复缴费金额不予退还，但不会影响已享受的医保待遇。

四、特殊情况处理

• 系统或操作错误 ：因网络、系统故障导致的重复缴费，可联系当地医保部门申请退费。

• 长期未处理 ：若超过规定时间未处理，可能导致医保账户异常，需优先通过医保部门渠道解决。

五、注意事项

1. 地区政策差异 ：不同地区对重复缴费的退费政策存在差异，建议提前咨询当地医保部门。

2. 避免重复参保 ：升学、就业等情况下应主动终止旧参保关系，防止新参保覆盖同一时段。

3. 保留缴费凭证 ：退费申请需提供完整证据材料，建议妥善保存缴费凭证以备后续查询。

若通过上述方式仍无法解决，可向当地社保部门或法律机构寻求进一步帮助。