吉林通化社保基数12900扣税金额因个人情况而异，一般在几百元左右。

1. 社保构成及扣除比例：

   • 社保通常包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。以养老保险为例，一般个人缴纳比例为工资的8%左右，具体比例可能因地区政策有所差异。
   • 医疗保险个人缴纳比例通常在2%左右，同样会因地区政策有所不同。失业保险个人缴纳比例较低，一般在0.5%左右。
   • 工伤保险和生育保险由单位全额缴纳，个人不需要承担费用。

2. 个人所得税计算：

   • 社保扣除后的工资需要缴纳个人所得税。个税起征点目前为每月5000元。
   • 应纳税所得额 = 社保扣除后的工资 - 起征点。
   • 根据应纳税所得额的不同区间，适用不同的税率，从3%到45%不等。

3. 其他影响因素：

   • 公积金也是影响实际到手工资的重要因素之一，个人缴纳比例一般在5% - 12%之间。
   • 还有一些专项附加扣除，如子女教育、继续教育、大病医疗等，可以在计算个税时扣除，进一步减少应纳税额。

要准确计算吉林通化社保基数12900扣税多少，需要综合考虑社保各项费用的扣除、个人所得税的计算以及可能存在的其他扣除项目。建议咨询当地税务部门或专业财务人员以获取最准确的信息。