吉林辽源社保基数为13800时，个人所得税的扣税情况主要取决于具体的扣除项和税率。以下是详细的计算和分析：

1. 1.社保及公积金扣除：养老保险：通常为基数的8%，即13800*8%=1104元。医疗保险：一般为基数的2%，即13800*2%=276元。失业保险：一般为基数的0.5%，即13800*0.5%=69元。住房公积金：一般为基数的12%，即13800*12%=1656元。总计扣除：1104+276+69+1656=3105元。
2. 2.应纳税所得额计算：起征点：根据现行税法，起征点为5000元。扣除项：社保及公积金扣除3105元。应纳税所得额：13800-5000-3105=5695元。
3. 3.税率及速算扣除数：根据现行税率表，5695元落在第2级税率区间（3000元至12000元），税率为10%，速算扣除数为210元。应缴税款：5695*10%-210=359.5元。
4. 4.其他可能扣除项：专项附加扣除：如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等，根据个人实际情况进行扣除。例如：如果个人有子女教育扣除1000元，住房贷款利息扣除1000元，则应纳税所得额进一步减少：5695-2000=3695元。重新计算税款：3695*10%-210=159.5元。
5. 5.基础情况下，吉林辽源社保基数为13800时，个人所得税约为359.5元。考虑专项附加扣除后，税款可能降至159.5元。实际扣税金额需根据个人具体情况进行详细计算，建议使用税务软件或咨询专业税务人员以获得准确结果。

通过以上分析，可以看出社保基数13800的扣税情况受多种因素影响，建议大家在申报纳税时仔细核对各项扣除项，以确保合法合规地享受税收优惠。