住院医保报销的办理部门及流程如下：

一、报销部门

1. 社保局或医保局

   参保人员可通过当地社保局或医保局办理报销手续。部分地区已实现社保局与医保局的职能合并，具体以当地政策为准。

2. 定点医疗机构医保结账窗口

   若在定点医疗机构住院，出院时可直接通过医院医保结账窗口完成初步报销，剩余自费部分需后续处理。

二、报销流程

1. 材料准备

   需携带以下材料：

   • 住院发票/费用清单

   • 出院记录/病历资料

   • 身份证/户籍证明

   • 医保卡（部分地区需提供）。

2. 提交申请

   • 医院端 ：出院时直接结算医保部分，自费部分由患者垫付。

   • 线下办理 ：将材料提交至当地社保局、医保局或政务中心的医保窗口。

3. 审核与结算

   • 社保部门审核材料后，报销款项将直接打入医保卡账户或银行账户。

   • 若涉及异地就医，需额外提供转诊证明。

三、注意事项

1. 报销范围限制

   仅限符合医保目录的药品、诊疗项目及急诊、抢救费用，未纳入目录的项目不予报销。

2. 发票管理

   报销时需提供原始发票，部分机构会直接收走。

3. 异地就医

   若在非参保地就医，需提前办理异地就医备案，按指定医疗机构就医并提交转诊证明。

四、特殊情况处理

• 农合/新农合 ：需通过农村合作医疗机构垫付费用，持身份证、农合证等材料到乡镇合管所或市医保业务管理中心办理。

• 大额医疗费用 ：可能涉及大病医保，需额外申请并符合相关条件。

建议办理前咨询当地医保部门，确认具体流程及材料要求，以确保顺利报销。