如果您发现自己同时缴纳了社保和农合，不必过于担心，您可以选择保留一种保险并办理另一种的退保手续，通常建议优先考虑保留待遇更优厚的职工社保。 在处理这种情况时，您需要了解相关的政策规定，并根据自身实际情况做出最合适的选择。

明确社保与农合（新型农村合作医疗）之间的差异是非常重要的。社保涵盖了包括养老保险、医疗保险在内的五种保险，而农合主要针对的是农村地区的居民，提供基本的医疗保障。由于两者在覆盖范围和服务内容上存在重叠，因此不能同时享受两份养老金或双重的医疗报销。

根据您的个人情况决定是保留社保还是农合。如果您长期在城市工作且有稳定的职业，那么继续缴纳职工社保可能更为合适，因为其提供的保障范围和待遇水平相对更高。反之，如果您的生活重心在农村地区，或者预计未来可能会回到农村居住，那么可以考虑保留农合。

接下来，如何操作成为关键步骤。若决定保留社保，则需前往当地社保中心开具缴费凭证，然后凭此凭证到农合管理部门申请停保及退费手续。需要注意的是，不同地区的具体流程可能有所差异，务必提前咨询相关部门获取最新信息。

还有一种特殊情况需要注意：如果您之前参加了农合后来转为城镇职工身份，并开始参加城镇职工基本养老保险，那么您之前的农合缴费可以根据相关规定折算为城镇职工养老保险的缴费年限，以实现养老保障的连续性和有效性。

提醒广大参保人定期检查自己的保险状态，确保没有重复缴费的情况发生。对于已经发生的重复缴费，及时联系相关机构进行处理，避免不必要的经济损失。通过上述措施，可以有效解决社保与农合重复缴纳的问题，确保每位参保人都能得到应有的社会保障权益。