内蒙古通辽社保基数9900元和5000元的区别主要体现在个人和单位需要缴纳的社保费用上，具体如下：
社保缴费基数
- 9900元基数：如果个人工资为9900元，且当地社保缴费基数上限为24315元，那么9900元可能接近或略高于上限，具体取决于当地社保政策对上限的定义和计算方法。
- 5000元基数：如果个人工资为5000元，且当地社保缴费基数下限为4863元，那么5000元可能处于下限和上限之间，具体位置取决于当地社保政策对下限和上限的具体规定。
社保缴费比例
- 养老保险：单位和个人共同承担，其中单位缴费比例为16%（实际比例可能因政策调整而有所不同），个人缴费比例为8%。
- 医疗保险：单位和个人共同承担，其中单位缴费比例为9.5%（实际比例可能因政策调整而有所不同），个人缴费比例为2%（包含大额医疗部分）。
- 失业保险：单位和个人共同承担，其中单位缴费比例为0.5%，个人缴费比例也为0.5%。
- 工伤保险：由单位承担，个人不用缴纳，缴纳比例为0.5%-2%（具体比例可能因行业和工作性质而有所差异）。
- 生育保险：由单位承担，个人不用缴纳，缴纳比例为1%。
请注意，以上信息仅供参考，具体的社保缴费金额还需根据当地社保政策和实际情况进行计算。
