根据相关法律规定和搜索结果，新农合住院报销与工伤报销在政策上存在明确区分，具体说明如下：

一、两者不能同时报销

1. 报销范围冲突

   工伤保险与新型农村合作医疗保险（新农合）的报销范围存在重叠，但两者是独立的保障体系。工伤事故属于工伤保险的专属报销范围，而新农合主要覆盖基本医疗保障需求。根据《工伤保险条例》第三十条规定，工伤医疗费用由工伤保险基金支付，不属于新农合报销范围。

2. 避免重复报销

   若同时申报可能导致医疗费用被重复支付，因此法律明确规定两者不可同时使用。

二、特殊情形说明

1. 住院期间新农合报销的影响

   若工伤职工在住院期间已通过新农合报销部分医疗费用，后续申请工伤保险时，工伤保险基金将优先支付符合规定的费用，但会扣除新农合已报销的部分。

2. 责任划分的医疗费用

   • 第三方责任 ：若工伤由第三方（如交通事故）导致，医疗费用由第三方承担，职工可向第三方索赔，但不可同时向工伤保险或新农合索赔。

   • 职工自费部分 ：职工需自行承担的医疗费用（如超出医保目录部分），可凭协议或证明向新农合报销。

三、注意事项

• 时间顺序要求 ：新农合报销需在医疗费用发生后及时申请，但不会影响工伤认定的时效（一般为事故发生后1年）。

• 骗保风险 ：若通过不正当手段（如虚报费用）同时申报，可能面临罚款甚至刑事责任。

新农合住院报销与工伤报销不可同时进行，需根据责任主体和费用性质选择合适的保障方式。