关于工伤后申报新农合可能引发的纠纷，综合相关法律规定和搜索结果，主要影响及处理方式如下：

一、主要影响

1. 工伤认定受阻

   新农合是医疗保障体系，与工伤保险分属不同保障范畴。若工伤发生后先报新农合，可能被认定为“自行处理医疗费用”，影响工伤认定机关对事故因果关系的判断。

2. 赔偿计算复杂化

   • 若新农合已报销部分医疗费用，工伤保险赔偿时需扣除该金额，避免重复赔付；

   • 不同地区对工伤报新农合后的处理规定存在差异，可能引发争议。

3. 法律责任风险

   • 重复享受医保可能被认定为“骗取医保基金”，面临行政处罚（如罚款、追回已报销费用）；

   • 若涉及金额较大，可能触犯《刑法》中诈骗罪，需承担刑事责任。

二、处理建议

1. 优先选择工伤保险

   工伤应通过工伤保险程序申报，避免同时申报新农合。若用人单位未依法缴纳工伤保险，可要求其承担医疗费用。

2. 及时沟通协调

   若已报新农合，应立即通知用人单位和社保部门，提供医疗费用凭证、工伤认定决定书等材料，协商明确责任划分。

3. 保留证据维权

   收集所有医疗费用发票、就医记录、工伤认定书等，为后续协商或诉讼提供依据。

4. 专业法律咨询

   复杂情况下建议咨询律师，根据当地政策判断是否需退回已报销费用，或通过劳动仲裁、诉讼解决争议。

三、注意事项

• 避免二次赔付争议 ：若用人单位已承担医疗费用，无需再报新农合或工伤保险；

• 区分工伤与疾病 ：新农合仅覆盖疾病医疗费用，工伤医疗费用应通过工伤保险处理。

工伤后申报新农合可能引发多方面纠纷，建议依法依规处理，以保障自身权益。