医保到账金额与缴费不一致，主要原因是缴费分为个人账户和统筹账户两部分，个人缴费进入个人账户可直接查询，单位缴费则划入统筹账户用于公共医疗支出，因此到账金额通常少于总缴费额。

1. 账户划分机制
   医保缴费由个人和单位共同承担，个人缴纳部分（如工资的2%）全额进入个人账户，用于门诊、购药等个人医疗支出；单位缴纳部分（如8%）划入统筹账户，用于大病报销、住院费用等公共医疗支出，因此查询到的余额仅为个人账户部分。

2. 系统延迟与更新周期
   缴费后医保系统可能存在数据更新延迟，尤其是跨地区或集中缴费期，需等待1-3个工作日才能显示最新余额。灵活就业人员因缴费比例更高，到账金额差异可能更明显。

3. 费用扣除与报销规则
   若已使用个人账户支付医疗费用或购药，余额会相应减少。部分报销需经审核周期，款项到账前余额可能暂时低于缴费总额。

4. 特殊参保类型影响
   灵活就业人员或公务员补助医保等特殊类型，缴费比例和账户分配规则不同，例如灵活就业缴费可能仅30%-50%进入个人账户，其余纳入统筹。

总结：医保到账金额与缴费差异是正常现象，主要受账户划分、使用记录及参保类型影响。若长期存在显著差异，建议核对缴费明细或咨询当地医保部门。