成都市第三人民医院作为国家三级甲等综合性医院，尤其擅长心血管疾病、呼吸系统疾病、消化系统疾病、神经疾病及肿瘤等五大核心领域，并拥有省内领先的介入治疗、微创手术和疑难重症救治能力。其特色专科覆盖心脏瓣膜手术、肺癌综合治疗、ERCP内镜技术、脊柱畸形矫治等高难度诊疗项目，同时妇产科、儿科、乳腺甲状腺外科等专科实力突出。
心血管疾病领域，医院是四川省心血管病区域医疗中心，在冠心病介入治疗、心脏瓣膜手术及房颤射频消融术等方面技术精湛，年手术量超3.8万台。呼吸系统疾病诊疗依托钟南山院士工作站，对肺癌、肺栓塞及慢性气道疾病采用多学科联合诊疗模式，纤支镜技术和呼吸危重症救治成功率居西南前列。
消化系统疾病方面，医院拥有四川省消化系统疾病临床医学研究中心，擅长ERCP、超声内镜等微创技术治疗肝胆胰疾病，炎症性肠病诊治水平获国家级认证。神经疾病专科聚焦脑血管病和脊柱畸形，卒中中心急救地图覆盖全市，重度脊柱侧弯矫治手术量连续多年全国领先。
肿瘤综合治疗以乳腺癌、胃癌、结直肠癌为重点，保乳手术和腹腔镜肿瘤根治术实现个性化精准治疗。妇产科在妇科肿瘤腔镜手术、高危妊娠管理上经验丰富，儿科对哮喘和免疫功能低下患儿有独到治疗方案。
对于复杂疑难病例，医院通过5个市级研究所和多学科会诊机制提供一体化解决方案，患者可优先选择其国家级重点专科或省市级质控中心挂靠科室就诊。
