跨省合作医疗报销确实存在时间限制，具体规定如下：

一、报销时间限制

1. 跨年度报销限制

   一般情况下，新农合报销仅限当年医疗费用，跨年度的费用需在下一年度内完成报销。若超过一年未报销，需等到下一年度重新参保后处理。

2. 跨结算年度限制

   即使在当年内，跨结算年度（如2024年）的医疗费用需在次年2个月内完成报销，逾期超过2个月将不予结算。

3. 转诊单有效期

   转诊备案的有效期为3个月，超过有效期未办理延期的，逾期发生的费用不纳入直接结报范围。

二、特殊情况处理

• 长期异地居住或工作人员 ：可在线备案后跨省就医，出院后直接结算。

• 中途转院 ：需在3个工作日内向转入地合管中心备案，转出地医院需开具转诊证明。

三、报销流程注意事项

1. 提前备案 ：通过国家医保服务平台或当地合管中心办理异地就医备案。

2. 材料准备 ：出院时需携带身份证、新农合医疗证、住院结算单、费用清单等材料。

3. 费用审核 ：部分省份要求提供每日用药清单、检查项目明细等辅助材料。

四、法律依据

相关法律依据主要来自《中华人民共和国社会保险法》及各地医保政策规定，不同省份可能存在细微差异，建议参保人员提前咨询当地医保部门确认具体细则。

跨省合作医疗报销需在时间限制内完成备案、就医和材料提交，否则可能影响报销比例或导致费用无法结算。