新农合确实可以申请特殊病种，但具体流程和范围需根据当地医保政策执行，以下是综合说明：

一、特殊病种认定条件

1. 疾病范围

   包括慢性肾功能衰竭（透析治疗）、恶性肿瘤门诊放化疗、器官移植术后抗排异治疗等17类疾病，以及高血压病（II期）、糖尿病、类风湿关节炎等。

   • 部分地区将中风后遗症、帕金森氏病等也纳入特殊病种。

2. 费用要求

   年度累计治疗费用需超过1000元，部分地区允许每季度申报。

3. 病史要求

   需满足2个月以上病史记录。

二、申请流程

1. 提交材料

   • 身份证、合作医疗证、病历资料、诊断证明、辅助检查报告、近期免冠照片等。

   • 部分地区需填写《特殊病种门诊申请表》。

2. 审核流程

   • 由乡镇合医办或定点医疗机构进行初审，确认材料真实性和疾病诊断。

   • 经医保部门复核通过后，发放《新型农村合作医疗门诊统筹补偿资格审批表》。

3. 待遇享受

   • 持证到定点医疗机构就诊，可按比例报销门诊费用。

   • 报销比例因地区政策差异较大，通常为50%-70%。

三、注意事项

1. 地区差异

   特殊病种目录及报销比例因省份、城市不同存在差异，建议提前咨询当地医保部门。

   • 例如，河南省将尿毒症纳入特殊慢性病门诊，而其他地区可能未包含。

2. 动态调整

   各地医保部门可能定期调整病种目录，需关注最新政策。

3. 申请时效

   通常每年办理一次，费用较大的可每季度申报，具体以当地规定为准。

四、补充说明

• 糖尿病、高血压等慢性病 ：部分地区已纳入特殊病种管理，但需符合当地具体条件。

• 罕见病 ：如渐冻症、血友病等，部分地区通过专项基金或扩大病种覆盖，需咨询当地医保局。

建议参保人员携带相关材料到当地医保部门或乡镇合医办咨询，确认具体申报流程和待遇标准。