南京市医保卡在药店购药是否可以走社保报销，需根据具体情况判断，具体说明如下：

一、医保卡在药店购药的报销规则

1. 定点药店直接结算

   在南京市医保定点药店购药时，符合医保目录的药品费用可通过医保直接结算，持医保卡刷卡支付即可。

   • 甲类药品 ：全额纳入医保报销范围；

   • 乙类药品 ：部分费用可报销，个人需自付一定比例。

2. 个人账户支付

   若医保卡内个人账户有余额，门诊费用可直接划扣。但需注意：

   • 个人账户资金仅限支付门诊费用，住院费用需通过医院结算；

   • 个人账户累计额超过当地职工年平均工资5%的部分，可支付门诊非处方药费用。

二、注意事项

1. 医保目录限制

   仅限购买《基本医疗保险药品目录》《诊疗项目目录》及《医疗服务设施标准》内的项目，超出部分需自费。

2. 结算方式

   • 符合条件的费用由医保基金、个人及药店三方直接结算，无需手动申请报销；

   • 若个人账户余额不足，需自付差额。

3. 特殊情况处理

   • 若在非定点药店购药，通常无法直接使用医保，需先自费后通过其他渠道报销。

三、总结流程

1. 持医保卡到南京市医保定点药店购药；

2. 确认药品/服务在医保目录内；

3. 直接刷卡结算，符合条件部分由医保基金支付，个人账户余额不足时补差。

建议购药前咨询当地医保部门或药店，确认具体用药目录及报销政策，避免遗漏。