医保卡每年有5000元通常指的是个人账户中可能会被划入的金额，或者是参保人员在一年内可以报销的医疗费用上限额度。这一数额具体取决于当地的医保政策和个人情况，如在职或退休状态、工资水平等。

一、个人账户划入 对于在职职工而言，医保卡每年的5000元可能是指个人和单位按照一定比例缴纳的医疗保险费用中，划入个人账户的部分。这通常包括了个人缴费部分以及单位为员工额外缴纳并划入个人账户的部分。例如，在某些地区，45岁以上的职工，单位可能会额外划入1.4%的工资到个人账户。

二、报销额度 另一种理解是，5000元代表的是医保报销的年度限额。这意味着在一个自然年内，参保人员通过医保卡可以报销的医疗费用总额不超过5000元。不过，这个数字并非固定不变，它会根据各地医保政策的不同而有所差异。有些地方可能规定门诊、住院、药品等各项费用共享这一报销限额，而在其他地方，则可能对不同类型的医疗服务设有独立的报销上限。

三、灵活就业人员 特别地，针对灵活就业人员，国家出台了一项政策，即符合条件的灵活就业者每年可以获得最高5000元的医疗保险报销。这项政策旨在为没有固定雇主的个体提供必要的医疗保障支持。

四、起付线与报销比例 值得注意的是，即使存在5000元的报销限额，实际可获得的报销金额还受到起付线和报销比例的影响。例如，如果设置了800元的起付线，那么只有超过此金额的部分才能按规定的比例进行报销，且总报销额不会超过5000元。

五、特殊情况补助 对于特定群体，比如退休人员，在定点医疗机构发生的属于基本医疗保险基金支付范围内的个人负担的医疗费用，若年度内累计超过5000元以上，还可以由医疗保险统筹基金给予适当补助。

总结来说，医保卡每年涉及的5000元概念多样，既可能是个人账户的资金注入，也可能是报销额度的限制。了解具体的含义需要结合当地的医保政策以及个人的具体情况来确定。无论哪种情形，都体现了国家和社会对公民健康权益的关注与保障。如果您想要获取最准确的信息，请咨询当地的社会保险机构或查阅最新的官方公告。