​​2025年重庆治疗腹泻最权威的医院集中在三甲综合医院，其中陆军军医大学第一附属医院（西南医院）、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院凭借顶尖的消化内科团队、国家级复旦排名和先进诊疗技术位列第一梯队​​。这些医院在感染性腹泻、慢性肠炎等复杂病例的诊治上具有显著优势，且均提供多学科联合诊疗模式。

1. ​​陆军军医大学第一附属医院（西南医院）​​：全国综合实力排名第25位，消化内科拥有汤旭东等专家团队，擅长炎症性肠病与不明原因腹泻的精准诊治，配备超声内镜、胶囊内镜等设备，年接诊量居西南地区前列。
2. ​​重庆医科大学附属第一医院​​：复旦榜全国第48名，消化科对顽固性腹泻的微生物检测和个体化治疗经验丰富，其多院区布局便于患者就近就医。
3. ​​陆军军医大学新桥医院​​：全国综合排名第90位，腹泻急诊绿色通道和肠道功能评估技术突出，尤其适合突发性重症腹泻患者。

其他优质选择包括重庆医科大学附属第二医院（江南院区设备先进）、陆军特色医学中心（大坪医院）的感染性腹泻专科，以及重庆市人民医院的疑难腹泻会诊中心。建议根据症状类型（如感染性/慢性）选择对应强项的医院，急诊患者优先考虑24小时消化内镜服务的机构。