根据我国医疗保障政策，农村户口新生儿的医保参保选择需根据家庭户籍性质和居住地政策决定，具体如下：

一、政策背景与合并情况

1. 制度合并

   我国已将新型农村合作医疗保险（新农合）与城镇居民医疗保险合并为 城乡居民基本医疗保险 （简称“城乡医保”），统称“城乡居民医保”。该政策于2016年全面推行，农村户籍居民和城镇非从业居民均可参保。

2. 缴费标准与待遇差异

   • 城乡医保由财政和缴费人共同承担，但保障水平低于职工医保；

   • 新农合（原制度）已随政策整合，不再单独存在。

二、农村户口新生儿的参保选择

1. 根据户籍性质参保

   • 若新生儿落户时户籍仍为农村，则需参加 城乡居民医保（新农合） ，费用由家庭共同承担；

   • 若新生儿随父母迁入城镇并落户为城镇户籍，则需参加 城镇居民医保 。

2. 办理流程

   • 凭出生证、户口本等材料向户籍所在地医保部门办理参保登记，通常在出生后90天内完成。

三、特殊情况说明

• 父母就业情况 ：若父母在城镇工作并参加职工医保，新生儿可随父/母参保职工医保，但需办理户口迁移；

• 重复参保问题 ：避免同时参加城乡居民医保和职工医保，否则可能影响待遇享受。

四、其他注意事项

• 报销范围与比例 ：城乡居民医保的报销范围和比例低于职工医保，但门诊、住院等基本医疗保障仍可享受；

• 缴费时间 ：需在每年规定时间内缴费，逾期可能影响次年待遇。

建议根据家庭实际情况（如户籍、父母就业等）选择合适的医保类型，并咨询当地医保部门确认具体办理流程。