合作医疗和职工医保确实存在冲突，具体分析如下：

一、政策规定层面

1. 国家明令禁止重复参保

   根据《中华人民共和国社会保险法》第二十四条规定，新型农村合作医疗（新农合）与职工医疗保险属于社会保障体系中的医疗保险类别，国家明确规定不得同时参加。

2. 重复参保的法律效力

   若同时缴纳两种保险，将导致医疗费用重复报销，医保系统会优先支付职工医保待遇，新农合的报销将被暂停。

二、实际操作影响

1. 报销范围与待遇差异

   • 职工医保 ：覆盖城市职工及灵活就业人员，缴费基数较高，报销比例通常为70%-90%（视地区政策）。

   • 新农合 ：主要覆盖农村居民，缴费标准较低，报销比例约为50%-70%。

2. 缴费与待遇选择

   • 若已参加职工医保，则需注销新农合，反之亦然。

   • 新农合无个人账户，不存在转移或叠加缴费的问题。

三、特殊情形说明

• 农村户口城市就业人员 ：可同时缴纳新农合和职工医保，但报销时只能选择其中一种。建议优先选择职工医保，因其保障更全面。

• 已参加职工医保的农村居民 ：需办理参保注销手续，否则可能影响后续医疗费用报销。

四、建议方案

1. 注销不必要的保险 ：根据户籍或就业状态选择保留职工医保或新农合。

2. 关注政策动态 ：部分地区可能推行城乡居民医保（统称“新农合”）替代新农合，需咨询当地医保部门。

合作医疗与职工医保因政策规定和保障范围冲突，无法同时参保。建议根据自身实际情况选择最适合的医疗保障方式。