针对农村自建房未批先建的问题，根据相关法律法规和实际操作流程，可采取以下措施：

一、补办手续的合法途径

1. 符合规划条件补办手续

   若房屋符合当地规划要求，需缴纳罚款后，携带土地使用证明、规划许可等材料向土地资源管理局和建设管理部门申请补办手续。

2. 分阶段处理历史遗留问题

   对因政策调整或历史原因形成的未批先建，可结合地方政策申请整改期限，但需符合现行规划标准。

二、强制拆除的情形

1. 严重违规行为

   若房屋超面积、占用耕地或违反“一户一宅”原则，将认定为违法建筑，需限期拆除；拒不执行者将面临强制拆除并追缴费用。

2. 安全隐患或刑事犯罪

   因未批先建导致重大安全事故或触犯刑法（如非法占用农用地罪），相关责任人可能被追究刑事责任。

三、其他处理方式

1. 罚款前置程序

   部分地区要求违法建筑所有人先缴纳罚款，再补办手续，罚款金额由当地政策规定。

2. 分户政策优化

   通过细化分户条件（如年龄、婚姻状况），减少因分户套取宅基地的违规行为。

四、注意事项

• 主动配合整改 ：建议及时与相关部门沟通，避免因逾期不整改而面临强制拆除。

• 法律咨询 ：具体操作前可咨询律师，确认是否符合补办条件及流程。

未批先建的处理需结合房屋合规性、当地政策及政府监管措施，优先引导合法化整改，必要时依法拆除。