跨省农合报销流程可分为以下步骤，综合多个权威信息源整理如下：

一、备案登记（关键环节）

1. 线上备案

   通过“国家异地就医备案”小程序或当地医保平台线上办理，需提供身份证、参合证等材料。

2. 电话或现场备案

   持身份证、参合证到县合管办现场办理，或拨打医保咨询电话登记。

3. 急诊备案

   突发疾病可先就医，入院后3日内电话报备（需保留通话记录）。

二、选择定点医院

1. 查询定点机构

   登录“国家医保服务平台”或当地医保部门官网，选择跨省联网定点医院（优先选择直接结算医院）。

2. 确认医院资质

   确保所选医院在医保目录内，避免因信息错误影响报销。

三、住院登记与费用管理

1. 办理入院手续

   出示身份证、新农合医疗证办理住院登记，主动告知医院备案信息。

2. 核对费用明细

   要求医院提供每日用药清单、检查项目明细及特殊治疗说明（如进口器械使用）。

四、出院结算

1. 直接结算

   在开通跨省直结的医院直接抵扣报销部分，患者仅需支付自付费用。

2. 手工报销

   若医院无法直接结算，需先垫付医疗费用，携带以下材料回参保地报销：

   • 住院发票原件

   • 费用总清单

   • 出院小结或诊断证明

   • 身份证和农合卡复印件

   • 转诊证明（如需）

五、回参合地审核

1. 提交材料

   将上述材料提交至参保地县合管办，通常需15个工作日内完成审核。

2. 审核结果

   符合报销条件的费用将按比例报销，比例通常为合理费用的45%-70%，具体取决于医院级别。

六、注意事项

1. 时效性

   转诊单有效期3个月，超期需重新备案。

2. 材料完整性

   出院小结、诊断证明等材料需与住院记录一致，否则可能影响报销。

3. 异地长期居住备案

   若在异地长期居住，需提供居住证明；在外务工人员需提供务工单位证明。

建议办理前通过医保官方渠道确认最新政策，不同地区可能存在细微差异。