跨省住院农村合作医疗报销比例通常根据医院等级和医疗费用类别有所不同。例如，三级医院住院的报销比例一般为65%-80%，二级医院为70%-90%，而一级医院则可能达到90%以上。参保人员需先办理跨省异地就医备案，备案成功后可在联网定点医疗机构直接结算，无需垫付费用。

具体政策要点：

1. 备案流程：参保人员可通过国家医保服务平台APP、小程序或参保地经办机构办理跨省异地就医备案。备案成功后，可持医保电子凭证或社会保障卡在备案地联网定点医疗机构直接结算。

2. 报销比例差异：不同医院等级的报销比例有所区别。例如，在三级医院住院，政策范围内费用报销比例为65%-80%；在二级医院，报销比例可达70%-90%；而在一级医院，报销比例可能高达90%以上。

3. 费用类别区分：甲类基本医疗费用报销比例较高，而乙类费用（如医用材料）需个人先行自付一定比例后再按报销比例结算。

4. 起付线标准：住院起付线通常按医院等级和医疗费用比例设定。例如，三级医院起付线可能为1200元，二级医院为800元，一级医院为300元。

5. 直接结算范围：备案成功后，参保人员在联网定点医疗机构可直接结算住院费用，无需垫付。

跨省住院农村合作医疗报销比例因医院等级、费用类别和地区政策而异，三级医院报销比例一般为65%-80%，二级医院为70%-90%，一级医院可达90%以上。参保人员需提前办理备案，并持医保凭证在联网定点医疗机构直接结算，确保报销便捷高效。