医保缴费900多元但个人账户余额只有100多元，可能的原因有以下几点：

1. 缴费档次较低 ：如果你选择的是较低的医保缴费档次，或者所在地区的医保政策规定的个人账户划入比例较低，那么你的医保余额自然会相对较少。

2. 个人账户划入比例 ：职工医保分为灵活就业人员医保和职工医保，这两种医保的缴费都比较高，但个人部分并不多，而且个人部分还不能全部划入个人账户，有一部分还划入了社会统筹。

3. 医保使用情况 ：如果你在过去的一段时间内使用了较多的医疗费用，医保余额就会相应减少。这包括在定点医院和药店的购药支出，以及门诊和住院费用的报销等。

4. 政策调整 ：随着医保制度的不断完善和调整，个人账户的划入比例、使用范围等都可能发生变化，这也会直接影响到医保余额的多少。

5. 缴费时间 ：医保余额的计算通常是基于一个缴费周期，比如一年一次。如果你在某个缴费周期内缴费，但个人账户的资金还未完全划入，那么查询到的余额可能会显示较少。

6. 信息同步问题 ：如果你更换了工作地点，涉及到医保关系的转移接续，但还未成功完成，那么也可能暂时查询不到医保余额。

7. 账户激活 ：拿到社保卡后通常需要激活医保卡，否则无法查询到医保余额。

8. 查询方式 ：不同地区的医保查询软件和平台可能不同，如果你使用的查询方式不正确，可能会导致查询到的余额有误。

医保缴费900多元但个人账户余额只有100多元，可能是由于个人缴费档次、医保政策、使用情况、政策调整、缴费时间、信息同步问题、账户激活以及查询方式等多种因素共同作用的结果。建议你仔细核对个人的缴费记录和医保政策，或者咨询当地的医保机构，以获取更准确的信息。