新农合与职工医疗保险存在以下冲突和差异，需根据参保人员身份和实际情况选择参保方式：

一、参保资格与覆盖范围冲突

1. 不得重复参保

   根据国家规定，城乡居民（包括新农合参保人员）与职工医保参保人员不得同时参加两种医疗保险，否则将导致重复享受待遇。

   • 农村户口城市就业人员 ：若同时缴纳新农合和职工医保，需选择其中一种进行报销。

2. 保障范围差异

   • 新农合 ：主要覆盖住院医疗费用，门诊报销比例较低（如镇卫生院60%、二级医院40%、三级医院30%）。

   • 职工医保 ：覆盖门诊、住院及部分特殊病种，报销比例普遍高于新农合（如70%-90%）。

二、缴费标准与待遇差异

1. 缴费差异

   职工医保由单位和个人共同缴纳，费用较高；新农合仅由个人缴纳，费用较低。

2. 待遇差异

   职工医保的门诊、住院报销比例及药品目录覆盖范围更广，且设有个人账户；新农合主要针对大病住院，小病门诊报销有限。

三、缴费年限与待遇计算差异

1. 年限不累计

   新农合缴费年限不能直接折算为职工医保年限，两者属于独立制度。

2. 退休待遇差异

   职工医保达到法定退休年龄后，待遇延续且待遇水平较高；新农合退休后可能降低保障水平或终止保障。

四、特殊情况处理建议

1. 已参保新农合后参加职工医保

   若已缴纳13年新农合，后续参加职工医保时，新农合缴费年限将停止计算，但可保留1年缴费记录。

2. 灵活就业人员选择建议

   无雇工的个体工商户、灵活就业人员等可参加职工医保，无需再缴纳新农合。

3. 报销材料要求

   两种医保报销均需提供身份证、诊断证明等材料，但职工医保对材料要求更严格。

总结

新农合与职工医保在政策设计上存在根本差异，无法同时享受。建议根据自身身份（如是否为城镇职工、户籍性质等）选择合适的医保类型。若已参加职工医保，可放弃新农合；若仍在农村且符合条件，可考虑转为职工医保或城镇居民医保。