合作医疗缴费后显示未参保，可能由以下原因导致，需结合具体情况排查：

一、信息采集问题

1. 未完成参保登记

   若未在户籍所在地或参保机构完成个人信息采集，系统将无法识别参保状态。

2. 信息录入错误

   身份证号、姓名等关键信息录入错误会导致查询失败，需核对后重新提交。

二、缴费状态异常

1. 系统延迟或网络问题

   网络不稳定或系统延迟可能导致缴费状态更新滞后，可尝试重新登录或检查网络。

2. 缴费未成功

   若采用线上缴费，可能因支付失败、账户余额不足等原因导致缴费未实际完成。

三、特殊群体政策

1. 免缴人群未确认

   符合免缴条件（如低保、残疾人等）的人群，需主动申请免缴，系统默认不参保。

2. 职工医保注册名不匹配

   若职工医保注册姓名与身份证不一致，需联系医保局核验并修改。

四、缴费周期问题

1. 错过缴费期

   新农合通常有集中缴费期，若未在此期间缴费，系统可能显示未参保。

2. 欠费未补缴

   若欠费超过3个月，系统可能暂停参保状态，需补缴后重新激活。

解决建议

1. 线下核查

   携带身份证、社保卡到当地社保经办机构办理大厅查询。

2. 线上查询

   登录当地社保局官网或拨打12333热线，输入社保编码、密码查询。

3. 特殊群体处理

   若属于免缴人群，联系社保局确认免缴资格；若因信息错误，提供证明材料申请更正。

若以上方法仍无法解决，建议通过12333热线或当地社保局官网提交详细问题描述，获取进一步帮助。