单位为职工办理医保时取消原有农村医保的流程如下：

一、单位主动办理（适用于单位统一参保情况）

1. 单位出具证明

   单位需为职工出具《参保人员退出新型农村合作医疗保险证明》，需包含职工姓名、身份证号、退出原因（如入职职工）及单位盖章。

2. 职工提交材料

   职工携带身份证、单位出具的证明到当地 县农合办公室 （或社保局医保窗口）办理注销手续。

3. 办理流程

   • 填写退保申请表并提交材料；

   • 社保机构审核通过后，职工将停止缴纳新农合费用，医保待遇终止。

二、职工自主办理（部分地区支持）

1. 单位协助提供材料

   若单位未主动办理，职工可要求单位提供退出新农合的证明。

2. 个人提交申请

   职工携带身份证、单位证明到当地社保局或医保办事处办理停保手续。

三、注意事项

1. 地区差异

   部分地区仅支持停保而非直接注销，职工需持续缴费至年底才能停止参保。

2. 时间限制

   新农合通常每年9月25日至10月9日为缴费期，缴费结束后自动停止参保。

3. 特殊情况处理

   • 若因单位参保导致个人无法注销，需咨询社保局是否可合并转移；

   • 退保时需配合提供升学、就业等证明材料。

建议办理前通过当地社保局官网或12333热线确认具体流程，避免遗漏材料或跑空。