新农合在县级医院的住院报销比例根据医院等级和地区政策有所不同，具体如下：

一、报销比例标准

1. 县级定点医疗机构

   • 起付线500元：报销65%

   • 起付线500元（不含）至10000元：报销65%

   • 超过10000元：报销50%

2. 其他医疗机构

   • 乡（镇）卫生院：报销85%（部分地区如紫阳县为90%）

   • 市级医院：报销55%

   • 省级医院：报销50%

二、起付线标准

• 县级医院 ：500元

• 乡（镇）卫生院 ：200元（部分地区如紫阳县为0元）

• 市级医院 ：700元

• 省级医院 ：1000元

三、其他注意事项

1. 年度报销限额 ：门诊累计最高5000元，超出部分自费

2. 大病二次报销 ：自费超5000元触发，1-10000元补65%，10001-18000元补70%

3. 特殊人群 ：

   • 60岁以上老人：三级医院报销50%且免起付线

   • 儿童/学生：三级医院报销55%，一级医院65%

四、地区差异

报销比例存在地区差异，经济发达地区（如浙江）报销比例更高，经济欠发达地区（如河南）可能更低。例如：

• 浙江：县级医院报销70%

• 河南：县级医院报销65%

建议参保人员就医前咨询当地医保部门，以获取最新政策细则。