关于合作医疗断缴期间住院报销的问题，综合相关政策和搜索结果，具体说明如下：

一、断缴期间医疗费用的报销规则

1. 断缴时间在3个月内的情况

   若单位或个人在断缴后3个月内补缴，补缴后3个月内发生的医疗费用可以报销。

2. 断缴时间超过3个月的情况

   断缴超过3个月后，即使补缴，医疗费用需从补缴后第二个月开始报销，断缴期间的费用无法弥补。

3. 断缴超过6个月的情况

   若断缴超过6个月，补缴后仍需等待1-3个月（部分地区可能延长至6个月）才能恢复报销，且缴费年限不连续计算。

二、特殊说明

• 补缴时效性 ：补缴必须在医疗费用发生前完成，逾期将无法享受报销。

• 缴费年限计算 ：断缴期间不计入连续缴费年限，仅计算为累计年限。

• 自费项目 ：如门诊费、自购药品、工伤事故等均不在报销范围内。

三、建议

1. 及时补缴 ：发现断缴后应尽快联系单位或社保部门补缴，避免影响后续医疗费用报销。

2. 保留证据 ：住院期间保留好医疗费用发票、诊断证明等材料，便于报销时提交。

3. 咨询当地政策 ：不同地区对断缴补缴的具体规定可能略有差异，建议通过当地社保部门或官方渠道确认。

若因断缴导致医疗费用无法承担，可咨询当地医疗保障部门或法律援助机构，了解其他救助途径。